Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY6

ZFP28, Zinc finger protein 28 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP28Q8NHY6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZFP28Q8NHY6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZFP28Q8NHY6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms