Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SPC24Q8NBT2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms