Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FOXD4L3Q6VB84 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms