Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
SMARCD3Q6STE5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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SMARCD3Q6STE5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
SMARCD3Q6STE5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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