Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CASC4Q6P4E1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CASC4Q6P4E1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms