Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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WSCD1Q658N2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
WSCD1Q658N2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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