Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALFQ53S48 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms