Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms