Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms