Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP25-1Q3LHN0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005921.3-201ENST00000623774 2151 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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