Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CDKN3Q16667 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms