Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCBQ16585 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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