Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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