Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN9AQ15858 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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