Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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EFNB3Q15768 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
EFNB3Q15768 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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