Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SKIV2LQ15477 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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