Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SYCP1Q15431 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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SYCP1Q15431 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SYCP1Q15431 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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