Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCOLCEQ15113 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCOLCEQ15113 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PCOLCEQ15113 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PCOLCEQ15113 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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