Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHD4Q14839 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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