Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTCH1Q13635 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PTCH1Q13635 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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