Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CUL4AQ13619 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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