Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HDAC1Q13547 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HDAC1Q13547 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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