Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CLEC5A-207ENST00000551012 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NIPA2P4-201ENST00000523928 1341 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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MKRN4PQ13434 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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MKRN4PQ13434 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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