Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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AP3B2Q13367 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AP3B2Q13367 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms