Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ITGB3BPQ13352 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ITGB3BPQ13352 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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