Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM2Q13029 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM2Q13029 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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