Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTP4A2Q12974 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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