Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDH17Q12864 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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