Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SLFN5Q08AF3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms