Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDE4DQ08499 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms