Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL9Q07325 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CXCL9Q07325 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250.5 ms