Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TYRO3Q06418 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms