Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPN11Q06124 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPN11Q06124 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms