Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms