Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPCQ03188 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms