Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ACTBP60709 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ACTBP60709 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ACTBP60709 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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ACTBP60709 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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