Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SH3BGRP55822 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3BGRP55822 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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