Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC11A1P49279 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms