Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CDKN1BP46527 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CDKN1BP46527 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms