Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCAMP43121 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCAMP43121 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms