Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZEB1P37275 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms