Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FDFT1P37268 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms