Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ARL3P36405 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms