Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJA4P35212 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GJA4P35212 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms