Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP1P29466 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASP1P29466 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASP1P29466 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms