Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
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