Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF1P22415 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF1P22415 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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