Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SYT1P21579 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SYT1P21579 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms