Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL9A1P20849 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms