Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRHP20396 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRHP20396 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRHP20396 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRHP20396 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms